Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUD5

Nup205, Nucleoporin 205, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup205A0A0J9YUD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup205A0A0J9YUD5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nup205A0A0J9YUD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup205A0A0J9YUD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup205A0A0J9YUD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup205A0A0J9YUD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup205A0A0J9YUD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms