Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms