Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trbv23A0A0A6YWQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trbv23A0A0A6YWQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trbv23A0A0A6YWQ1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trbv23A0A0A6YWQ1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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