Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trbv31A0A075B5J5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Trbv31A0A075B5J5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trbv31A0A075B5J5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trbv31A0A075B5J5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Trbv31A0A075B5J5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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Trbv31A0A075B5J5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trbv31A0A075B5J5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trbv31A0A075B5J5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Trbv31A0A075B5J5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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