Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn3Q9Z0G9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.6 ms