Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDAC9Q9UKV0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDAC9Q9UKV0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms