Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnt3Q9QZ47 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnt3Q9QZ47 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms