Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rab5aQ9CQD1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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