Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC38A3Q99624 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms