Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Spdl1Q923A2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spdl1Q923A2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spdl1Q923A2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Spdl1Q923A2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms