Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc50Q810U5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms