Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q71RC1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q71RC1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q71RC1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q71RC1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q71RC1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q71RC1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q71RC1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q71RC1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q71RC1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms