Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCTP1Q6DN14 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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