Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc3lQ4KL14 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms