Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLEQ07864 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLEQ07864 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms