Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CRB1P82279 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB1P82279 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CRB1P82279 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CRB1P82279 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms