Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SIM1P81133 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SIM1P81133 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SIM1P81133 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SIM1P81133 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms