Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csrnp3P59055 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csrnp3P59055 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms