Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SagP20443 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SagP20443 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SagP20443 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SagP20443 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SagP20443 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SagP20443 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms