Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRAP18433 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRAP18433 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRAP18433 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRAP18433 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRAP18433 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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