Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd4P10628 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd4P10628 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms