Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cldn4O35054 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cldn4O35054 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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