Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Gm21818J3KMS6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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