Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Raph1F2Z3U3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Raph1F2Z3U3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms