Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85cE9Q6B2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc85cE9Q6B2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms