Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Irx4Q9QY61 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx4Q9QY61 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms