Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ropn1Q9ESG2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms