Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
4930524J08RikQ9CUJ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms