Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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