Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1N4

Nudcd3, NudC domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd3Q8R1N4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nudcd3Q8R1N4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd3Q8R1N4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd3Q8R1N4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nudcd3Q8R1N4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms