Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms