Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp27Q8CEG8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp27Q8CEG8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp27Q8CEG8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp27Q8CEG8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp27Q8CEG8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp27Q8CEG8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp27Q8CEG8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Usp27Q8CEG8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp27Q8CEG8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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