Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE3BQ7Z3V4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms