Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RSPH4AQ5TD94 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH4AQ5TD94 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms