Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syne3Q4FZC9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms