Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNIP1Q15025 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms