Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SHPRHQ149N8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHPRHQ149N8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms