Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcn1Q05186 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms