Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FNTBP49356 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FNTBP49356 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FNTBP49356 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms