Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNA5P30532 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms