Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHRNB1P11230 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHRNB1P11230 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms