Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm10477F6SW83 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms