Protein–RNA interactions for Protein: A9Q751

Cfap221, Cilia- and flagella-associated protein 221, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap221A9Q751 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cfap221A9Q751 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cfap221A9Q751 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms