Protein–RNA interactions for Protein: A2AMT6

Vmn1r2, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r2A2AMT6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r2A2AMT6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms