Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC9Q9UKV0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms