Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Chchd1Q9CQA6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Chchd1Q9CQA6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms