Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMD1Q99460 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms