Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GCN1Q92616 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCN1Q92616 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms