Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Supt16hQ920B9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Supt16hQ920B9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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