Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ApofQ91V80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ApofQ91V80 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms